1939年9月1日，德国入侵波兰。9月3日，英法对德国宣战，二战正式爆发。“警卫旗队”和其他几支党卫队特别机动部队一道首次走上战场，派普也第一次接受了战争的洗礼，但不是作为“警卫旗队”的一员，而是跟着希姆莱在战场上转了一圈。当1940年5月法国战役打响后，派普被希姆莱派往前线，出任“警卫旗队”第3营第11连排长，不过仍挂着希姆莱副官的头衔。在这次战役中，他带队追击撤退的法军，俘虏了一个连的敌军。因此，派普获得了二级和一级铁十字勋章，并晋升为党卫军上尉，并升任第11连连长。

　　1941年6月“巴巴罗萨”行动开始1941年10月，派普的部队也被调往前线。1941年10月，派普跟随部队杀到罗斯托夫(Rostov)城下，但在苏联红军的打击下，“警卫旗队”只能放弃刚刚攻克的罗斯托夫，和其他德军部队一道撤过米乌斯河(the Mius)，掘壕据守。在1941年的东线战役中，“警卫旗队”伤亡惨重，不得不撤到法国重组，直到1942年底才重返东线。在此期间，“警卫旗队”被扩编为一个装甲掷弹兵师，而派普也在1942年9月被任命为党卫军第2装甲掷弹兵团第3营营长，并在1943年1月晋升为党卫军少校。